正当北方积极备战准备大举进攻的时候南京的南明朝廷却混乱一场。
本来史可法亲临扬州稳定了忠于南明的大臣们在军事上的地位；但他过早离开朝廷却加了一场政治危机的到来。因为史可法不在朝中所谓“正人君子”便缺少一位足以同马士英及勋贵集团抗衡的强有力的人物。
马士英本来是驻守信阳的可是他并不甘心仅仅做一个藩镇这位1619年的进士在掌握兵权以后野心迅膨胀但他本人并无足够的军队来成大事然而在朝廷勋臣中马士英很容易就找到足了够的同盟者其中最重要的是：操江提督诚意伯刘孔昭、南京提督忻城伯赵之龙。这些勋臣都是帮助朱元璋创建明朝的将军们的后裔他们对文官当权心怀不满将朱慈烺视为自己的保护人将马士英视为强大的盟友希望恢复其家族自明初便已失去的某些权力。
双方一拍即合很快的马士英就带着大量的钱财来到南京拜谒各种官员也开始结党营私和他的同盟者们商量如何铲除东林党。
自从北京的高级官员纷纷涌入南京以来大批东林党人也在北京陷落后云集南京。其中不少人包括原来在崇祯时受到排挤的官员此时颇受人们的欢迎并被授以高位。
在弘光皇帝的五位大学士中至少有两人——张慎言和姜曰广——是众所周知的东林党人。两位左都御史徐石麒和刘宗周也明显地属于“正人君子”一党：前者曾因支持黄道周而受到魏忠贤的指控和迫害；后者的名字即是东林党所追求的刚正不阿精神的象征。实际上刘宗周接受弘光朝廷的职位将意味着对朝廷贤明的认可并进而证实其权威的合法性。
但当弘光帝登基之后这位思想家决定不在朝为官。事情的起因在于新的科举考试为了巩固自己的地位迅招揽门人形成势利以马士英为的保守集团即勋贵集团（主要包括各种皇室成员和历代世系的爵爷）操纵了这次科举考试这其中最为关键的人物就是陈子龙。
自从受到皇帝的重用以后陈子龙深感自己势单力薄与史可法他又格格不入因为从前的底子不干净使得他觉得史可法等人总是高他一头所以当马士英向他抛出橄榄枝的时候他欣然接受。
陈子龙不是傻子他深知这次科考的重要性毕竟这是朝廷南迁之后的第一次开科考试同时这一次录取的文人也将会在今后的政权中作为中坚力量所以掌握这些人才是至关重要的。而由于皇帝的信任他得到了监考官的职权这也正是马士英频频向他招手示好的原因所在。
陈子龙深知自己的地位和能量从他当初投靠魏忠贤的那一刻起读书人的礼仪廉耻已经都不重要了他最看重的就是权利有了权利就有了一切。因此他费尽了心机才偷到考试试题并且将之有选择性的告诉了马士英等人同时也召集了一些自己的门生故旧以及昔日“志同道合”的同窗进以辅导结果揭榜之日就成了马士英和陈子龙等人最兴奋的日子他们这一系全线飘红而东林党人大多名落孙山即使有考中的名次也不靠前。
对于中了进士乃至状元的这些人的学识刘宗周一清二楚他完全看出了这其中的猫腻但是却很难找到罪魁祸毕竟主考是张慎言和姜曰广他们是绝对不可能出现问题的而陈子龙则没有这种机会并且这个年轻人一项老老实实（陈子龙深知枪打出头鸟的道理所以做人很低调他和马士英的联络都是秘密进行的）。对于这样的难题刘宗周解决的办法倒是很简单就是要求重新考试但是这无疑是有损皇帝的威严的马士英等人以此为由力阻。年幼的朱慈烺是很容易受人左右的尤其是史可法不在朝中马士英等人的气焰立时嚣张所以他没有同意刘宗周的意见。
或许是为了换取皇帝的重视吧刘宗周决定以罢官相威胁6月23日他回绝了弘光帝请他出任左都御史的任命返回了绍兴老家。7月11日大概是在得知皇帝不允许其推辞之后他又离开了家乡来到杭州。他三次上疏不指名地谴责了皇帝周围的一些大臣。而后来到南京东面的丹阳等待皇帝对其奏疏的答复。就在这一时期他为自己取号为“草莽孤臣”以此表
明对已故皇帝而不是对建立南明的当今皇帝的忠诚这一举动很容易被马士英以“妄自尊大”的罪名加以指责甚至可以因其不愿到弘光朝廷作官而被指责为大不敬。刘宗周这种除非皇上接受其建议否则不愿入朝为官的态度可以被视为对马士英或弘光帝本人的傲慢不恭但对那些将其奉为楷模的“正人君子”来说却有着重大象征意义。
一时之间由科举而引起的纷争骤然而起因为东林党无法向马士英那样取得军队的支持为了否定这次科举他们别无选择只好使出他们最拿手的政治手段：通过对官吏的铨选和品评来控制文官。大学士、东林党人张慎言已是吏部尚书；另一位东林党人兵部左侍郎解学龙又推荐黄道周作吏部左侍郎与张慎言呼应。
通过这一任命东林党人掌握了人事大权。于是他们立即着手将其支持者安插于要职。例如：解学龙提议让黄道周的最重要的政治盟友叶廷秀任户部主事。
这种情况下马士英自然不甘落后他也迅行动起来一方面他坚持肯定科举的必要性和公正性以使得自己的党徒窃据要职另一方面对东林党人试图占据政府重要职位的努力进行反击。他阻挠对叶廷秀的任命提议召勋臣刘孔昭入阁使之成为第六位大学士从而转变朝廷最高层权力分配的现状。
由于刘孔昭非科举出身又由于勋臣担任大学士从无先例吏部尚书张慎言轻而易举地否定了这一任命。刘孔昭大怒立即作出反应推荐马士英为大学士这一举措立刻得到皇帝的批准马士英轻松的挤入内阁。
1634年6月27日早朝时刘孔昭又在勋臣赵之龙支持下当着皇帝的面对张慎言进行突然袭击。他指责张慎言拒绝任用勋臣武将而以推荐吴甡、郑三俊等勾结李自成的罪臣为官的方式图谋反叛。他还指责张慎言利用吏部的任免之权在朝中安插亲信而被安插者又都与东林党过往甚密。最后这位勋臣对张慎言进行了人身攻击叫骂道：“皇上张慎言排斥武臣结党行私非杀此老奸不可”
整个朝堂上现在都一下子静了下来随着刘孔昭此言一出整个明争暗斗的党争变得白热化和公开化张慎言听到这话简直怒不可遏只见他的胸部剧烈起伏沉重的呼吸声很多人都听得到。
“皇上既然刘大人说臣排斥武臣结党行私非杀臣不可那么臣请辞吏部尚书一职至于皇上杀不杀臣还请皇上决断君要臣死臣不得的不死！”最后的这几个字说的掷地有声那分明就是给小皇帝看的这完全就是和刘宗周走的一个路子逼小皇帝就范。
“皇上臣等也请辞！”刘宗周话音刚落高弘图与姜曰广也同时出列要求辞职。
“众位爱卿何苦如此呢如今国家正
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